Normalement, la maj dois se faire en toute transparence pour toi... cependant, si tu as installé des patchs, ou addons, il y a un risque d'incompatibilité sur la version finale. C'est pourquoi, je te recommande de faire la maj sur un clone de ton site en préprod mais surtout pas directement sur ton site en prod... Histoire de bien verrifier que tout se passe correctement.
Bonne maj !
Réglement (pour ne pas le perdre de vue ^^). Je ne suis pas développeur, je suis bidouilleur ! :)